Az e-számlák kiállítása - hasonlóan a normál számlákhoz - a SUP® Számviteli modul Pénzügy | Belföldi számlák készítése és a Pénzügy | Devizás számlák készítése menüpontban. A SUP® Raktári modulban az Áruforgalom | Kimenő számlák készítése menüpontban történik.
Az e-számlákat ugyanúgy kell felvinni, mint a normál számlákat. A különbség a nyomtatáskor mutatkozik, mivel az e-számlák esetén nyomtatás helyett a számla hitelesítése történik. A hitelesített e-számlák - a normál kinyomtatott számlákhoz hasonlóan - a későbbiekben már nem módosíthatók.